Thèse Contribution des Propriétés Mécaniques du Microenvironnement Tumoral dans la Progression et la Résistance aux Traitements des Tumeurs Pancréatiques Canalaires H/F - Doctorat.Gouv.Fr

Établissement : Aix Marseille Université École doctorale : Recherches Biomédicales Laboratoire de recherche : DyNaMo - Dynamique et nanoenvironnement des membranes biologiques Direction de la thèse : Michaël SEBBAGH ORCID 0000000324687006 Début de la thèse : 2026-10-01 Date limite de candidature : 2026-05-19T23:59:59 Une tumeur est un écosystème complexe comprenant des cellules tumorales hétérogènes. La rhéologie ou la rigidité tumorale ainsi que de son microenvironnement révèle une hétérogénéité évidente et cela au-delà des zones de nécrose ou de fibrose. Cependant, la rhéologie tumorale est peu documentée tout comme sa contribution dans les processus oncogéniques.
Par analogie avec l'immuno-histologie qui utilise des outils sérologiques pour caractériser les tumeurs, nous proposons de mettre en place une nouvelle approche, la 'rhéo-histologie' qui caractérise les tumeurs en cartographiant leurs propriétés viscoélastiques. Ce projet de thèse interdisciplinaire mettra en oeuvre cette nouvelle approche, couplée à une histologie multiplexée de dernière génération, permettra de caractériser et de mieux comprendre les domaines impliqués dans le maintien, l'expansion des tumeur pancréatiques canalaires. Le projet permettra aussi de déterminer la contribution des propriétés mécaniques de résistances aux traitements (chimiothérapies ou immunothérapies) ainsi que la contribution de l'innervation dans ces processus. Ces travaux permettront de mieux comprendre ce type de tumeurs en identifiant de nouveaux marqueurs diagnostiques et de développer potentiellement de nouvelles stratégies thérapeutiques qui font cruellement défaut.
PDACs are characterized by a complex, desmoplastic microenvironment, composed of dense and highly charged collagen fibers (essentially type V) leading to greater stiffness and loss of elasticity compared to healthy tissue. Transcriptomic analysis of the stroma and associated tumors, after laser microdissection have already been made allowing to stratify the PDACs according to five subtypes according to the therapeutic response, highlighting the heterogeneity in the tumor/stroma interrelationships5. However, TME stiffness heterogeneity were not taken in account which will be addressed by the project and enable to define whether TME rheological variations contribute to pancreatic tumors progression. This thesis project at the crossroad between cell biology and biophysics implements innovative and interdisciplinary approaches to address TME rheological contribution in pancreatic cancer progression and therapy resistances. Mainly restricted to materials science, rheology has been, this last decade, also applied to cell biology and more recently in histology. In the latter, studies focus on small area which do not inform on the whole tissue organization. Recently our lab highlights that intra-tumor rheological heterogeneity contributes to tumor aggressiveness6. An exceptional biobank including PDAC Patient derive xerographs (PDX) and organoids models highly characterized by patient records and multi-Omics data will be at the heart of the project7. Thus, samples from this Biobank will be implemented by a new two-step approach coupling Rheo-histology (defined by atomic force microscopy) and spatial transcriptomic recently available at the CRCM experimental histo-pathology. Thus, tumor gene expression will be associated to TME rheological features which will further study by cell biological and biochemical experiment8 to define cell signaling affected.

Pour être compétitif, le candidat doit être titulaire d'un master récent (idéalement en cours) ou justifier d'un éventuel intervalle entre l'obtention du diplôme et la demande de bourse doctorale pour la thèse.
Pour mener à bien ce projet, nous recherchons un candidat curieux, motivé et faisant preuve d'initiative.
Les profils de candidats en biologie et en biophysique seront étudiés.